我应该如何做数据的分类？

常见的数据分类方式有2种:
一种是按照数据所属的类别进行层次分类，一种是采用关键字或者标签的方式进行分类。

从前我都是用第一种，把相应的内容划分到一个有层次的类别中，这些类别可能是平级的也可能是无限级的。但我遇到了一个问题，有些文字可以属于很多个分类！我该怎么办？丢掉第一种而是用第二种？但是关键字/标签的输入问题挺麻烦，没有办法做到很容易的输入和分类。最终还是决定两个同事共存的方式去做。

最后我提出一个问题：到底哪种方式好呢？我想本身并不应该有明显的界限，如果数据本身就比较有层次划分如：生物学中的种、属、科、目等层次的分类，那么采用层次分类比较好；而言采用关键字的方式比较有弹性，使数据可以隶属为多个关键字，使单一数据适应多个分类。